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Pour la plupart des pays européens, l'un des principaux enjeux de la politique de recherche et d'innovation consiste à réussir à accroître la part de la dépense privée dans l'effort de recherche et à transférer à la société et à l'économie les résultats de recherche développés dans les établissements publics, pour qu'ils servent la croissance et l'emploi. Si l'Europe est encore loin de son objectif de porter à 3% du PIB le montant de sa dépense de R&D, c'est notamment en raison d'un investissement privé trop faible dans ce domaine comparé à des pays comme les Etats-Unis. C'est pourquoi, de nombreuses initiatives, des incitations fiscales aux programmes de financement, ont vu le jour afin de pousser les entreprises à augmenter leur dépense de recherche et développement, à s'associer avec des centres de recherche ou encore à créer de nouvelles entreprises sur des secteurs à forte valeur ajoutée technologique.
Les politiques de développement technologique ont donc été renforcées en étant couplées aux politiques de recherche. De fait, le Pays Basque est l'une des rares régions espagnoles où l'effort de R&D s'est maintenu et a même augmenté ces dernières années. Comme l'indiquent les responsables basques, "la peur a été si forte lorsque les industries traditionnelles se sont effondrées" dans les années 80 qu'il existe un consensus réel sur la valeur de l'investissement dans la R&D afin d'éviter qu'une telle situation ne se reproduise. Le Pays Basque s'est lancé dans un programme de développement de son potentiel de production de connaissances, en le ciblant sur des thématiques d'importance mondiale liées aux spécificités locales. La seconde grande transformation de la communauté est en marche. Les acteurs basques espèrent qu'elle les conduira à faire de leur territoire le territoire de référence en matière de recherche et d'innovation en Europe.